MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori XZ274 chromosome

Total Repeats: 34102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017926	TGAG	2	8	121	128	25 %	25 %	50 %	0 %	387907369
2	NC_017926	CATT	2	8	208	215	25 %	50 %	0 %	25 %	387907369
3	NC_017926	GAT	3	9	216	224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387907369
4	NC_017926	T	6	6	353	358	0 %	100 %	0 %	0 %	387907369
5	NC_017926	AAGC	2	8	389	396	50 %	0 %	25 %	25 %	387907369
6	NC_017926	T	7	7	412	418	0 %	100 %	0 %	0 %	387907369
7	NC_017926	T	7	7	440	446	0 %	100 %	0 %	0 %	387907369
8	NC_017926	TTC	2	6	450	455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907369
9	NC_017926	ACA	2	6	476	481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387907369
10	NC_017926	ACC	2	6	487	492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387907369
11	NC_017926	C	6	6	494	499	0 %	0 %	0 %	100 %	387907369
12	NC_017926	AAT	2	6	551	556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017926	C	6	6	736	741	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_017926	TAA	2	6	745	750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017926	AAC	2	6	792	797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017926	CT	3	6	798	803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017926	CTT	2	6	895	900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017926	TCTG	2	8	905	912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017926	TGA	2	6	913	918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017926	TTGCAA	2	12	962	973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017926	AAAT	2	8	1007	1014	75 %	25 %	0 %	0 %	387907370
22	NC_017926	AAC	2	6	1119	1124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387907370
23	NC_017926	CCGCAG	2	12	1138	1149	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387907370
24	NC_017926	CCA	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387907370
25	NC_017926	GCT	2	6	1307	1312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907370
26	NC_017926	CA	3	6	1321	1326	50 %	0 %	0 %	50 %	387907370
27	NC_017926	T	6	6	1338	1343	0 %	100 %	0 %	0 %	387907370
28	NC_017926	CTA	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907370
29	NC_017926	TC	3	6	1380	1385	0 %	50 %	0 %	50 %	387907370
30	NC_017926	T	6	6	1442	1447	0 %	100 %	0 %	0 %	387907370
31	NC_017926	ATA	2	6	1455	1460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907370
32	NC_017926	GGC	2	6	1498	1503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387907370
33	NC_017926	GCTT	2	8	1550	1557	0 %	50 %	25 %	25 %	387907370
34	NC_017926	CT	3	6	1656	1661	0 %	50 %	0 %	50 %	387907370
35	NC_017926	TAAAA	2	10	1696	1705	80 %	20 %	0 %	0 %	387907370
36	NC_017926	GTT	2	6	1718	1723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907370
37	NC_017926	TAG	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387907370
38	NC_017926	CTT	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907370
39	NC_017926	TTC	2	6	1857	1862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907371
40	NC_017926	A	7	7	1872	1878	100 %	0 %	0 %	0 %	387907371
41	NC_017926	ATTATA	2	12	1890	1901	50 %	50 %	0 %	0 %	387907371
42	NC_017926	CCTG	2	8	1905	1912	0 %	25 %	25 %	50 %	387907371
43	NC_017926	CCAA	2	8	1929	1936	50 %	0 %	0 %	50 %	387907371
44	NC_017926	TGAA	2	8	1969	1976	50 %	25 %	25 %	0 %	387907371
45	NC_017926	TTG	2	6	1993	1998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907371
46	NC_017926	T	6	6	2071	2076	0 %	100 %	0 %	0 %	387907371
47	NC_017926	TTC	2	6	2079	2084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907371
48	NC_017926	CAT	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907371
49	NC_017926	AATG	2	8	2159	2166	50 %	25 %	25 %	0 %	387907371
50	NC_017926	AAT	2	6	2199	2204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907371
51	NC_017926	TAG	2	6	2252	2257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387907371
52	NC_017926	G	6	6	2284	2289	0 %	0 %	100 %	0 %	387907371
53	NC_017926	GATTA	2	10	2343	2352	40 %	40 %	20 %	0 %	387907371
54	NC_017926	ATTC	2	8	2444	2451	25 %	50 %	0 %	25 %	387907371
55	NC_017926	TTTGT	2	10	2519	2528	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017926	TTC	2	6	2555	2560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017926	A	8	8	2637	2644	100 %	0 %	0 %	0 %	387907372
58	NC_017926	TCTT	2	8	2653	2660	0 %	75 %	0 %	25 %	387907372
59	NC_017926	T	7	7	2733	2739	0 %	100 %	0 %	0 %	387907372
60	NC_017926	T	7	7	2775	2781	0 %	100 %	0 %	0 %	387907372
61	NC_017926	AGC	2	6	2873	2878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387907372
62	NC_017926	GC	3	6	2886	2891	0 %	0 %	50 %	50 %	387907372
63	NC_017926	A	6	6	2924	2929	100 %	0 %	0 %	0 %	387907372
64	NC_017926	ATTAA	2	10	3020	3029	60 %	40 %	0 %	0 %	387907372
65	NC_017926	AG	3	6	3043	3048	50 %	0 %	50 %	0 %	387907372
66	NC_017926	GTG	2	6	3062	3067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387907372
67	NC_017926	AAG	2	6	3096	3101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387907372
68	NC_017926	AGA	2	6	3160	3165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387907372
69	NC_017926	CAAA	2	8	3196	3203	75 %	0 %	0 %	25 %	387907372
70	NC_017926	GTG	2	6	3221	3226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387907372
71	NC_017926	GCC	2	6	3228	3233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387907372
72	NC_017926	GAAA	2	8	3343	3350	75 %	0 %	25 %	0 %	387907373
73	NC_017926	GAAA	2	8	3418	3425	75 %	0 %	25 %	0 %	387907373
74	NC_017926	AGTG	2	8	3439	3446	25 %	25 %	50 %	0 %	387907373
75	NC_017926	TG	3	6	3525	3530	0 %	50 %	50 %	0 %	387907373
76	NC_017926	GTT	2	6	3674	3679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907373
77	NC_017926	GCGATA	2	12	3822	3833	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387907373
78	NC_017926	CAAG	2	8	3919	3926	50 %	0 %	25 %	25 %	387907373
79	NC_017926	A	6	6	3962	3967	100 %	0 %	0 %	0 %	387907373
80	NC_017926	ATT	2	6	4002	4007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907373
81	NC_017926	AC	3	6	4059	4064	50 %	0 %	0 %	50 %	387907373
82	NC_017926	GGC	2	6	4075	4080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387907373
83	NC_017926	GGT	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017926	TAT	2	6	4229	4234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017926	TGG	2	6	4273	4278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017926	ATGC	2	8	4370	4377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017926	TGG	2	6	4386	4391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017926	GTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017926	ACC	2	6	4534	4539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017926	GGT	2	6	4547	4552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017926	A	7	7	4668	4674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017926	T	8	8	4688	4695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017926	AAT	2	6	4709	4714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017926	TAAA	2	8	4777	4784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017926	A	6	6	4867	4872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017926	T	7	7	4919	4925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017926	A	6	6	4930	4935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017926	A	6	6	4946	4951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017926	TGT	2	6	4985	4990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017926	TTTTA	2	10	5009	5018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017926	TC	3	6	5054	5059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017926	A	6	6	5087	5092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017926	T	7	7	5097	5103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017926	ACTA	2	8	5139	5146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017926	A	6	6	5151	5156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017926	AGT	2	6	5220	5225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017926	AAAAAG	2	12	5236	5247	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017926	C	6	6	5254	5259	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_017926	A	7	7	5273	5279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017926	A	6	6	5290	5295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017926	TGC	2	6	5463	5468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907374
112	NC_017926	TCGC	2	8	5478	5485	0 %	25 %	25 %	50 %	387907374
113	NC_017926	CATT	2	8	5551	5558	25 %	50 %	0 %	25 %	387907374
114	NC_017926	ATT	2	6	5573	5578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907374
115	NC_017926	A	6	6	5783	5788	100 %	0 %	0 %	0 %	387907374
116	NC_017926	A	6	6	5825	5830	100 %	0 %	0 %	0 %	387907374
117	NC_017926	GTT	2	6	5873	5878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907374
118	NC_017926	TAA	2	6	5942	5947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387907374
119	NC_017926	GTTGA	2	10	5966	5975	20 %	40 %	40 %	0 %	387907374
120	NC_017926	TTA	2	6	6000	6005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907374
121	NC_017926	GTT	2	6	6089	6094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907374
122	NC_017926	GTGC	2	8	6129	6136	0 %	25 %	50 %	25 %	387907374
123	NC_017926	TCT	2	6	6213	6218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387907374
124	NC_017926	C	6	6	6235	6240	0 %	0 %	0 %	100 %	387907374
125	NC_017926	TTTGA	2	10	6341	6350	20 %	60 %	20 %	0 %	387907374
126	NC_017926	GCTTGC	2	12	6372	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907374
127	NC_017926	AGA	2	6	6419	6424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387907374
128	NC_017926	ATT	2	6	6458	6463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907374
129	NC_017926	TCA	2	6	6615	6620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907374
130	NC_017926	TGCT	2	8	6670	6677	0 %	50 %	25 %	25 %	387907374
131	NC_017926	T	6	6	6718	6723	0 %	100 %	0 %	0 %	387907374
132	NC_017926	TGT	2	6	6733	6738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907374
133	NC_017926	TTA	2	6	6777	6782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387907374
134	NC_017926	CAC	3	9	6796	6804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387907374
135	NC_017926	TAC	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387907374
136	NC_017926	GTTT	2	8	6819	6826	0 %	75 %	25 %	0 %	387907374
137	NC_017926	GTATGT	2	12	6833	6844	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387907374
138	NC_017926	TTG	2	6	6905	6910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387907374
139	NC_017926	TGGT	2	8	7019	7026	0 %	50 %	50 %	0 %	387907374
140	NC_017926	CCGTTC	2	12	7062	7073	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387907374
141	NC_017926	CA	3	6	7075	7080	50 %	0 %	0 %	50 %	387907374
142	NC_017926	ATCG	2	8	7202	7209	25 %	25 %	25 %	25 %	387907374
143	NC_017926	GCT	2	6	7229	7234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387907374
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